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May 14, 2023

Bactérias de cabo com conexão elétrica ao oxigênio atraem bandos de diversas bactérias

Nature Communications volume 14, Número do artigo: 1614 (2023) Citar este artigo

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Detalhes das métricas

Bactérias de cabo são bactérias filamentosas de centímetros de comprimento que conduzem elétrons através de fios internos, acoplando assim a oxidação de sulfeto em sedimentos anóxicos mais profundos com redução de oxigênio em sedimentos superficiais. Essa atividade induz mudanças geoquímicas no sedimento, e outros grupos bacterianos parecem se beneficiar da conexão elétrica com o oxigênio. Aqui, relatamos que diversas bactérias nadam em um bando compacto ao redor da parte anóxica das bactérias do cabo que respiram oxigênio e se dispersam imediatamente quando a conexão com o oxigênio é interrompida (cortando as bactérias do cabo com um laser). A microscopia Raman mostra que as bactérias floculadas são mais oxidadas quando mais próximas das bactérias do cabo, mas o contato físico parece ser raro e breve, o que sugere transferência potencial de elétrons por meio de intermediários solúveis não identificados. A análise metagenômica indica que a maioria das bactérias floculantes parece ser aeróbica, incluindo organotróficos, oxidantes de sulfeto e possivelmente oxidantes de ferro, que podem transferir elétrons para bactérias de cabo para respiração. A associação e a interação próxima com parceiros tão diversos podem explicar como o oxigênio via cabo bacteriano pode afetar comunidades microbianas e processos distantes em ambientes anóxicos.

As bactérias dos cabos são bactérias filamentosas longas que podem transmitir elétrons em distâncias centimétricas e, assim, acoplar a oxidação do sulfeto à redução remota de oxigênio ou nitrato1,2. Eles ocorrem globalmente em sedimentos e aquíferos marinhos e de água doce3,4,5 e interferem diretamente na ciclagem de enxofre, oxigênio, carbono e nitrogênio6. Por meio de gradientes de pH e campos elétricos induzidos por sua realocação de elétrons, eles também influenciam indiretamente o ciclo de ferro, cálcio, cobalto e arsênico e todos os fluxos de íons em seus habitats6,7,8,9. Em sedimentos de água doce, eles podem causar uma estimulação de 4,5 vezes na redução de sulfato e reduzir drasticamente a emissão de metano10,11.

A atividade das bactérias cabo também foi associada à assimilação aumentada de carbono de oxidadores de sulfeto autotróficos12 e correlacionada com a distribuição de bactérias cicladoras de ferro em sedimentos marinhos13. Essas aparentes associações levaram a especulações de que as bactérias em sedimentos anóxicos podem, de alguma forma, usar as bactérias do cabo como um conduto de elétrons para o oxigênio14,15.

Aqui, usamos uma combinação de observações microscópicas, sequenciamento de metagenoma, microdissecção a laser e microscopia Raman para demonstrar a dinâmica e a intimidade dessa associação, identificar provisoriamente as bactérias envolvidas e propor um mecanismo provável para transferência de elétrons entre bandos bacterianos associados e filamentos bacterianos de cabo .

Bactérias de cabo de um enriquecimento da cepa de água doce Ca. O Electronema aureum GS16 foi observado em condições semi-naturais em uma lâmina de microscópio (a chamada lâmina de trincheira), onde o oxigênio se difundiu a partir da borda da lamela, enquanto matéria orgânica, sulfeto e outros nutrientes foram fornecidos a partir de sedimentos em um centro compartimento (vala)17,18. Esta configuração estabeleceu uma zona de observação onde as bactérias do cabo se estenderam do sedimento para a interface óxi-anóxica, que foi claramente delineada por um véu microaerófilo de bactérias aeróbicas móveis (Fig. S1). Na parte anóxica da zona, até 4 mm de distância da interface óxico-anóxica, descobriu-se que células bacterianas nadam em bando em torno de segmentos de bactérias de cabo, geralmente superando em número as células de bactérias de cabo adjacentes em 2,2:1 (Fig. 1A, Filme S1, Tabela S1). O rastreamento detalhado das células mostrou um comportamento quimiotático em relação às bactérias do cabo: as células floculadas estavam concentradas perto dos filamentos das bactérias do cabo, com as maiores densidades celulares a uma distância de 20 µm, mas ainda com densidades aumentadas até pelo menos 50 µm de distância (Fig. 1B, Fig. . S2). Não houve nenhum padrão evidente de bactéria reunindo-se tocando bactérias de cabo, mas com as limitações de resolução dos microscópios de luz convencionais e a natureza dinâmica da interação impedindo métodos de resolução mais alta, atualmente não podemos excluir que o toque possa ocorrer; mas se assim for, foi raro e breve. A velocidade de natação das bactérias reunidas foi significativamente aumentada em uma distância de 20 µm (Fig. 1C), indicando um aumento da força motriz de prótons19,20,21. A fração de células bacterianas detectáveis ​​por hibridização fluorescente in situ (FISH) dentro de 10 µm de distância das bactérias do cabo foi significativamente maior do que > 10 µm de distância (Tabela S2), sugerindo que elas tinham uma maior contagem de ribossomos e, portanto, maior atividade metabólica em comparação com o volume bactérias do sedimento22. Juntos, isso indica altas taxas metabólicas dentro do bando e estimulação metabólica das bactérias floculantes quando se aproximam muito das bactérias do cabo.

1 mg ml−1 humic acids in lake sediment25, or flavins in the nM range in marine sediment26), shuttles do not have to be produced by cable bacteria or associated bacteria. Also, the turnover rate of a soluble mediator in this concentration range would be below 2 s (Supplementary Note 1, Table S4). This rapid turnover suggests an immediate depletion of the oxidized mediator once cable bacteria stop re-oxidizing its reduced form and thus explains the rapid dispersal of the bacterial flock upon cutting the connection of the filament to oxygen. That cable bacteria provide a potent oxidized electron shuttle seems the only plausible explanation for the proliferation of other bacteria associated with cable bacteria in the anoxic sediment compartment12,13, the amount and vigor of motile cells surrounding cable bacteria (Fig. 1A, Movie S1), and their rapid dispersal after cutting (Movie S2)./p>7 years in our laboratory./p>30% sequence identity over 70% of the length of the query sequence. A single positive BLAST match for an EET-related gene (see Supplementary Dataset 1) was considered a full match. Dissimilatory sulfite reductase (DsrAB) proteins were determined as being oxidative or reductive based on the best BLAST hit against a DsrAB database43. These combined kofamscan and BLAST methods were used to determine the traits shown in Fig. 3. Sulfide oxidation determination was based on the presence/absence of genes encoding reverse DsrAB or the Sox system. Sulfate reduction was based on the presence of dsrAB43. Aerobic respiration was based on the presence of at least one set of genes encoding a cytochrome c oxidase. Nitrate/nitrite respiration was based on the presence of genes encoding one of several nitrate or nitrite reductases. Autotrophy was indicated by the presence of acsAB (indicating the Wood–Ljungdahl pathway), cbbLS (indicating the Calvin Cycle), or nifJ/porCDAB/oorDABC (indicating the reverse citric acid cycle). Further pathways and genes for chemotaxis, flagellar assembly, glycolysis, and aerobic methane or formate metabolism were also screened but not included in Fig. 3. All details of accession numbers screened for these genes and pathways are included in the header of Supplementary Dataset 1./p>

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